檢驗(yàn)檢測
經(jīng)驗(yàn)分享:如何正確認(rèn)識(shí)新冠病毒核酸檢測中的內(nèi)標(biāo)基因
核酸檢測作為新冠肺炎感染者的確診依據(jù),在疫情防控中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。“內(nèi)標(biāo)”基因作為體現(xiàn)核酸檢測質(zhì)量的重要指標(biāo)之一,通常指實(shí)時(shí)熒光定量PCR中的內(nèi)參基因,能夠?qū)蝹€(gè)待測樣本本身的檢測環(huán)節(jié)進(jìn)行監(jiān)測,可作為質(zhì)控品的有力補(bǔ)充。 目前獲批的核酸檢測試劑盒基本都已經(jīng)加入“內(nèi)標(biāo)”,主要分為“外源性內(nèi)標(biāo)”和“內(nèi)源性內(nèi)標(biāo)”兩種,下面我們結(jié)合實(shí)驗(yàn)室經(jīng)常遇到的“樣本內(nèi)標(biāo)擴(kuò)增異常”情況,與大家討論一下,在質(zhì)控滿足要求時(shí),如何正確的認(rèn)識(shí)核酸檢測中的內(nèi)標(biāo)基因。
對(duì)于“外源性內(nèi)標(biāo)” 靶基因和內(nèi)標(biāo)均無擴(kuò)增 常見原因:無法明確是否存在檢驗(yàn)前問題,多數(shù)為檢驗(yàn)中內(nèi)標(biāo)樣本錯(cuò)加漏加、核酸加樣時(shí)錯(cuò)加漏加;若連續(xù)多個(gè)樣本存在此情況,首先考慮提取試劑、提取儀的問題。 靶基因有擴(kuò)增但內(nèi)標(biāo)無擴(kuò)增 常見原因:應(yīng)先明確靶基因是否同內(nèi)標(biāo)基因存在競爭或抑制作用,若不存在,原因同上,且該擴(kuò)增孔存在污染可能。 例圖1: 典型的高濃度樣本抑制內(nèi)標(biāo)基因擴(kuò)增。 圖 1 靶基因有擴(kuò)增但內(nèi)標(biāo)無擴(kuò)增 外源性內(nèi)標(biāo)基因擴(kuò)增明顯離散 常見原因:外源性內(nèi)標(biāo)最大特點(diǎn)為均勻性好,故個(gè)別樣本內(nèi)標(biāo)離散時(shí)多為反應(yīng)體系中存在抑制物;部分連續(xù)樣本內(nèi)標(biāo)離散時(shí),應(yīng)首先考慮提取試劑、提取儀的問題;若整板樣本內(nèi)標(biāo)離散時(shí),多為擴(kuò)增體系配制時(shí)未充分混勻。 例圖2: 該樣本反應(yīng)體系中存在抑制物。 圖 2 單個(gè)樣本內(nèi)標(biāo)基因離散 例圖3: 由于磁珠殘留、加熱模塊異常,造成多個(gè)連續(xù)樣本內(nèi)標(biāo)基因離散。 圖 3 多個(gè)樣本內(nèi)標(biāo)基因離散 以上應(yīng)對(duì)措施 更換試劑、耗材、儀器等條件進(jìn)行復(fù)檢;重新采樣檢測并嚴(yán)格按照sop操作等。 對(duì)于“內(nèi)源性內(nèi)標(biāo)” 檢驗(yàn)人員需首先明確 內(nèi)源性內(nèi)標(biāo)有擴(kuò)增不代表采樣成功,原因有3點(diǎn): 1.對(duì)于混采樣本,只需1個(gè)受試者采樣成功,內(nèi)源性內(nèi)標(biāo)就會(huì)有擴(kuò)增; 2.以RNase P內(nèi)標(biāo)為例,如不能正確采樣,僅采集口腔甚至皮膚樣本,同樣會(huì)有內(nèi)源性內(nèi)標(biāo)擴(kuò)增; 3.環(huán)境中可能會(huì)存在人源性樣本氣溶膠污染。但是,采樣不成功時(shí),內(nèi)源性內(nèi)標(biāo)一定無擴(kuò)增。 靶基因和內(nèi)標(biāo)均無擴(kuò)增 常見原因:實(shí)驗(yàn)室較為常見,涉及范圍較廣,包括檢驗(yàn)前樣本采集、保存、運(yùn)送問題;檢驗(yàn)中反應(yīng)體系、提取、擴(kuò)增問題以及人員操作問題等。 靶基因有擴(kuò)增但內(nèi)標(biāo)無擴(kuò)增 常見原因:情況極其少見,因內(nèi)源性內(nèi)標(biāo)基因與靶基因通常無競爭或抑制作用,所以原因同上,且該擴(kuò)增孔可能存在污染或非特異性擴(kuò)增。 例圖4: 采樣失敗且靶基因非特異性擴(kuò)增。 圖 4 靶基因非特異性擴(kuò)增且內(nèi)標(biāo)無擴(kuò)增 內(nèi)源性內(nèi)標(biāo)基因擴(kuò)增明顯離散 常見原因:由于采樣質(zhì)量直接影響內(nèi)標(biāo)擴(kuò)增結(jié)果,故曲線較離散屬于正常情況,并不一定是人員不規(guī)范操作引起的,所以這種情況較難界定。 例圖5: 若排除檢驗(yàn)前問題,整體內(nèi)標(biāo)曲線相對(duì)離散,可能由于樣本未充分振蕩混勻或擴(kuò)增體系配制時(shí)未充分振蕩混勻。 圖 5內(nèi)標(biāo)基因離散 以上應(yīng)對(duì)措施 更換試劑、耗材、儀器等條件進(jìn)行復(fù)檢;重新采樣檢測并嚴(yán)格按照sop操作等。 其他常見的異常內(nèi)標(biāo)曲線 曲線明顯分為兩簇 常見原因: 1.可能是提取儀異常導(dǎo)致提取效率低,多為加熱模塊故障、磁珠異?;虼胖闅埩?; 2.可能所用的反應(yīng)液放置時(shí)間過長導(dǎo)致擴(kuò)增效率下降; 3.可能是不同的采樣管內(nèi)的保存液對(duì)提取試劑的提取效率有影響。 圖 6 擴(kuò)增曲線分為兩簇 內(nèi)標(biāo)曲線不平滑(靶基因曲線正常) 常見原因:多為錯(cuò)用擴(kuò)增程序,如A試劑反應(yīng)體系使用了B試劑的擴(kuò)增程序,可重新選擇正確的熒光通道。 圖 7 內(nèi)標(biāo)曲線不平滑 不同的內(nèi)標(biāo)都各有利弊,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)根據(jù)具體的使用需求,科學(xué)看待和選擇。即“有內(nèi)標(biāo)不一定行,但無內(nèi)標(biāo)一定不行”。 核酸檢測過程中的每一個(gè)操作環(huán)節(jié)都有可能影響檢測結(jié)果,所以實(shí)驗(yàn)室必須規(guī)范化管理,出現(xiàn)樣本內(nèi)標(biāo)異常結(jié)果時(shí)也應(yīng)細(xì)心觀察、耐心分析,采樣人員采樣時(shí)也應(yīng)規(guī)范合理,最終保證核酸檢測的質(zhì)量,為疫情防控保駕護(hù)航。